Ο Ιωάννης Λίλης, επίκουρος Καθηγητής της Πατριαρχικης Ανώτατης Εκκλησιαστικής Ακαδημίας Κρήτης, μιλά για το ζήτημα της εκλογής του νέου μητροπολίτη Κυδωνίας και Αποκορώνου και την παρέμβαση της κυβέρνησης στα θέματα της Εκκλησίας της Κρήτης που οδήγησε σε αντιπαράθεση.
Μιλώντας στο Θέμα Κρήτης 103.1 και στην εκπομπή «Πίσω Σελίδες» με τον Μάριο Διονέλλη, τονίζει πως οι μητροπολίτες στην Ελλάδα ασκούν διοίκηση με ΝΠΔΔ και μία μετάθεση δεν μπορεί να γίνει τόσο εύκολα όμως σημειώνει ότι τον πρώτο και τον τελευταίο λόγο έχει η Σύνοδος και αν θελήσει να εκλέξει κάποιον που είναι ήδη μητροπολίτης, χρειάζεται μεν διπλή νομική διευθέτηση αλλά και αυτό θα μπορούσε να γίνει με ένα Π.Δ..
Όσον αφορά την παρέμβαση του κράτους στο «μεταθετό» που έγινε με την παραίνεση του Οικουμενικού Πατριαρχείου όπου ανήκει η Εκκλησία της Κρήτης, τονίζει ότι στόχος ήταν να προστατεύσει τους μητροπολίτες εκτός Ελλάδας διευκρινίζοντας ότι οι μητροπολίτες αυτοί θεωρούνται απλοί ιερείς και αναγνωρίζονται μόνο εκκλησιολογικά.
Όπως λέει, η Εκκλησία της Κρήτης θα ζητήσει να αλλάξει το νομοθέτημα προκειμένου να τοποθετηθεί ο νέος μητροπολίτης σύμφωνα με την κρίση της και τις διοικητικές ανάγκες ενώ απαντά στο ερώτημα για την επιμονή της Εκκλησίας να τοποθετηθεί ο μητροπολίτης Αμφιλόχιος, λέγοντας πως αυτό έχει ξαναγίνει και ότι οι εκκλησιαστικές ανάγκες είναι ιδιαίτερες.
Τέλος αναφέρεται στις αντιδράσεις μέρους της Εκκλησίας και στο πώς καταρτίζεται η σχετική λίστα με τους υποψήφιους και προσθέτει ότι ακόμα δεν υπάρχει χρονικός ορίζοντας για την εκλογή, η οποία μπορεί να πάρει και μήνες ενώ κλείνοντας αναφέρεται στην απουσία του αρχιεπισκόπου Ευγενίου από τη σημερινή εκδήλωση για την υπογραφή της σύμβασης του ΒΟΑΚ, σημειώνοντας ότι η απόφαση αυτή ήταν θεσμική και δεν παρεμβαίνει τόσο το προσωπικό θέμα σε ζητήματα που αφορούν τον ρόλο της εκκλησίας και της κυβέρνησης.